91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1032 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  91.88 
 
 
209 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  76.65 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  76.14 
 
 
210 aa  315  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  76.14 
 
 
210 aa  315  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  76.14 
 
 
210 aa  315  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  75.63 
 
 
210 aa  314  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  76.14 
 
 
210 aa  315  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  75.63 
 
 
210 aa  314  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  76.14 
 
 
210 aa  315  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  75.63 
 
 
210 aa  314  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  75.63 
 
 
211 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  75.13 
 
 
210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  55.78 
 
 
211 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  56.85 
 
 
207 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  58 
 
 
212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  57.5 
 
 
213 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  55.28 
 
 
215 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  57.65 
 
 
211 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  53.73 
 
 
213 aa  222  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  49.75 
 
 
209 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  54.75 
 
 
179 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  54.75 
 
 
179 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  46.97 
 
 
219 aa  207  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  49.49 
 
 
211 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  48.5 
 
 
210 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  48 
 
 
210 aa  191  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  49.74 
 
 
210 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  43.98 
 
 
238 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 
170 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.01 
 
 
212 aa  134  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.83 
 
 
282 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  29.85 
 
 
332 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  34.11 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  26.36 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.41 
 
 
215 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  27.56 
 
 
329 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  27.27 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.5 
 
 
867 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  33.59 
 
 
139 aa  45.1  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  29.36 
 
 
133 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2989  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.45 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15084  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2958  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.45 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3147  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.45 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00650637  normal  0.0214142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  34.94 
 
 
300 aa  44.7  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3040  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.45 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3024  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.45 
 
 
321 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000207652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.76 
 
 
242 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  27.82 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  27.82 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  30.99 
 
 
330 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  31.48 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  27.82 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  25 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  26.03 
 
 
611 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  28.04 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  29.29 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 
873 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  24.56 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  25 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1428 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  29.13 
 
 
322 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  30.4 
 
 
340 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  28.57 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  24.41 
 
 
137 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  28.57 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  27.12 
 
 
613 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 
138 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  27.73 
 
 
321 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  28.57 
 
 
138 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 
136 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  27.82 
 
 
138 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 
138 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  29.29 
 
 
212 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
225 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  26.52 
 
 
418 aa  41.6  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.87 
 
 
845 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.5 
 
 
907 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  25.74 
 
 
138 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  29.03 
 
 
144 aa  41.2  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
313 aa  41.2  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>