90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4253 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
215 aa  433  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  57.42 
 
 
211 aa  247  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  56.94 
 
 
211 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  55.5 
 
 
213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  54.55 
 
 
209 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  53.59 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  55.28 
 
 
197 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  50.48 
 
 
219 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  51.9 
 
 
213 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  51.92 
 
 
211 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  52.15 
 
 
209 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  52.88 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  52.88 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  53.37 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  52.88 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  53.37 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  52.88 
 
 
210 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  53.37 
 
 
210 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  53.37 
 
 
210 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  52.4 
 
 
210 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  52.88 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  47.37 
 
 
210 aa  208  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  49.76 
 
 
210 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  47.37 
 
 
210 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  47.6 
 
 
207 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  47.6 
 
 
211 aa  204  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  46.11 
 
 
179 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  46.11 
 
 
179 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  42.25 
 
 
238 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  41.63 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.58 
 
 
212 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  34.91 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
867 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  36.36 
 
 
502 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  37.5 
 
 
332 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
488 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  29.91 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.58 
 
 
503 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
124 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.74 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  30.28 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  31.4 
 
 
503 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  27.13 
 
 
511 aa  48.9  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  30.88 
 
 
491 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0629  KpsF/GutQ family protein  33.33 
 
 
328 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  31.09 
 
 
490 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  28.81 
 
 
492 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.42 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  33.33 
 
 
141 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.64 
 
 
769 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  29.41 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  28.45 
 
 
329 aa  45.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  31.58 
 
 
145 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34.38 
 
 
688 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  34.69 
 
 
502 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.33 
 
 
513 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  30.68 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  29.7 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  30.85 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  23.85 
 
 
500 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  33.33 
 
 
613 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  29.31 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0523  KpsF/GutQ family protein  29.35 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  28.06 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  30.4 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.33 
 
 
490 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  28.81 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  24.41 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.5 
 
 
513 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  29.21 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  30.95 
 
 
127 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  31.11 
 
 
146 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
131 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  26.89 
 
 
513 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
615 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
432 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
215 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  24.18 
 
 
221 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  30.82 
 
 
502 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 
615 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  25.18 
 
 
345 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  25.18 
 
 
345 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  31.18 
 
 
331 aa  41.6  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  27.48 
 
 
124 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>