43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2269 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  99.52 
 
 
210 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  63.64 
 
 
213 aa  264  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  52.83 
 
 
213 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  53.55 
 
 
211 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  51.66 
 
 
212 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  51.43 
 
 
211 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  51.66 
 
 
209 aa  220  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  53.3 
 
 
219 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  49.29 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  49.29 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  49.29 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  48.82 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  48.82 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  48.82 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  48.82 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  49.29 
 
 
210 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  49.29 
 
 
210 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  49.29 
 
 
211 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  48.82 
 
 
210 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.37 
 
 
215 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  48.82 
 
 
209 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  47.39 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  48.56 
 
 
207 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  48.5 
 
 
197 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.15 
 
 
210 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  43.6 
 
 
238 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  47.78 
 
 
179 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  47.78 
 
 
179 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.68 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  35.41 
 
 
209 aa  142  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  39.05 
 
 
170 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
689 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 
606 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  25.81 
 
 
606 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 
873 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  28.83 
 
 
135 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.34 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  40.62 
 
 
369 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0629  KpsF/GutQ family protein  28.7 
 
 
328 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  25.56 
 
 
182 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  25.16 
 
 
606 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.45 
 
 
250 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>