50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0486 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  100 
 
 
213 aa  426  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  66.2 
 
 
212 aa  297  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  63.85 
 
 
211 aa  287  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  63.03 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  57.35 
 
 
213 aa  248  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  59.24 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  57.42 
 
 
211 aa  241  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  57.89 
 
 
210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  57.89 
 
 
210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  57.89 
 
 
210 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  57.89 
 
 
210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  57.42 
 
 
210 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  57.42 
 
 
210 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  57.42 
 
 
210 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  57.42 
 
 
210 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  54.98 
 
 
209 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  57.42 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  56.94 
 
 
211 aa  237  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  52.83 
 
 
210 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  52.83 
 
 
210 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  51.2 
 
 
207 aa  227  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  53.73 
 
 
197 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  51.9 
 
 
215 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  50.71 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  49.76 
 
 
211 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  49.76 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  48.63 
 
 
179 aa  185  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  48.63 
 
 
179 aa  185  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  46.67 
 
 
238 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.84 
 
 
212 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  42.94 
 
 
170 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
209 aa  142  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  30.65 
 
 
487 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.62 
 
 
490 aa  48.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  30.26 
 
 
867 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  35.71 
 
 
201 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  25.78 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  48 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  48 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  48 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.17 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  33.98 
 
 
503 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  28.05 
 
 
322 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2287  CBS domain containing protein  27.27 
 
 
123 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332436  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.14 
 
 
903 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  33.33 
 
 
330 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0629  KpsF/GutQ family protein  35.62 
 
 
328 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.85 
 
 
769 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.51 
 
 
498 aa  41.6  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  28.89 
 
 
146 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>