17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2794 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2572  hypothetical protein  76.4 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  47.89 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  43.53 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.25 
 
 		 376 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 		 360 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  30.26 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.26 
 
 		 292 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.26 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2792  hypothetical protein  42.22 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  33.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  41.3 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2570  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  27.4 
 
 		 329 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2694  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00830  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.69 
 
 		 470 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0839  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.25 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>