42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4783 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  100 
 
 		 453 aa  891    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 463 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  58.25 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  53.95 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  59.08 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  56.86 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  42.49 
 
 		 457 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  41.11 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  42.28 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  40.69 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  41.19 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  43.04 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  34.82 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  31.55 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  29.08 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  24.93 
 
 		 939 aa  83.2  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 73 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.59 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  27.27 
 
 		 803 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0782  ADP, ATP carrier protein  23.46 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00645947  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.03 
 
 		 666 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  24.17 
 
 		 547 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 		 1056 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.24 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 528 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0505  hypothetical protein  21.15 
 
 		 918 aa  43.5  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.64 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>