105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2783 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  100 
 
 
296 aa  610  1e-174  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  70.07 
 
 
294 aa  439  1e-122  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  64.95 
 
 
299 aa  400  1e-110  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  66.89 
 
 
297 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  64.97 
 
 
298 aa  386  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  63.33 
 
 
302 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  64.63 
 
 
298 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  52.13 
 
 
307 aa  306  4e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  51.8 
 
 
307 aa  305  8e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  52.13 
 
 
307 aa  304  1e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  52.32 
 
 
304 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  50.99 
 
 
304 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  50.66 
 
 
304 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  46 
 
 
321 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  41.45 
 
 
308 aa  205  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  41.07 
 
 
284 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  41.07 
 
 
287 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  41.09 
 
 
284 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  41.09 
 
 
287 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  40.73 
 
 
284 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  39.53 
 
 
249 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  32.45 
 
 
284 aa  139  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  35.1 
 
 
286 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  38 
 
 
302 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  29.93 
 
 
316 aa  121  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  37.5 
 
 
301 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  34.03 
 
 
289 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  31.69 
 
 
292 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  29.33 
 
 
287 aa  112  7e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  34.78 
 
 
308 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  29.78 
 
 
303 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  31.58 
 
 
274 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  28.06 
 
 
290 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  28.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  28.57 
 
 
290 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  30.58 
 
 
275 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  29.46 
 
 
297 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  31.82 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  36.42 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  30.89 
 
 
324 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  29.53 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  29.02 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  28.5 
 
 
228 aa  84.7  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  30.37 
 
 
231 aa  84.7  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  30.89 
 
 
205 aa  82.8  7e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  25.91 
 
 
285 aa  80.5  3e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  33.53 
 
 
227 aa  80.1  4e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  25.45 
 
 
285 aa  79  8e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  25.45 
 
 
285 aa  79  8e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  29.89 
 
 
276 aa  77.4  3e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  25.58 
 
 
285 aa  75.1  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  25 
 
 
295 aa  74.3  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  27.59 
 
 
421 aa  74.7  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  27.68 
 
 
277 aa  73.2  5e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  23.88 
 
 
296 aa  70.9  3e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  28.19 
 
 
189 aa  70.5  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  28.09 
 
 
230 aa  69.7  5e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  27.23 
 
 
300 aa  69.7  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  28.49 
 
 
298 aa  69.3  7e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  28.49 
 
 
298 aa  69.3  7e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  29.57 
 
 
314 aa  68.9  9e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  27.59 
 
 
230 aa  68.2  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  29.03 
 
 
308 aa  68.6  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  28.49 
 
 
301 aa  67.8  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  26.79 
 
 
291 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  28.09 
 
 
231 aa  67.8  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  26.24 
 
 
290 aa  67  3e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  28.49 
 
 
304 aa  67.4  3e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  28.49 
 
 
304 aa  67.4  3e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  28.26 
 
 
301 aa  67  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  25.98 
 
 
303 aa  66.2  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  26.7 
 
 
293 aa  66.2  6e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  25.24 
 
 
292 aa  64.7  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  28 
 
 
260 aa  64.7  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  25.63 
 
 
292 aa  64.7  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  24.62 
 
 
292 aa  63.9  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  28.02 
 
 
290 aa  64.3  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  24.62 
 
 
292 aa  63.5  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  24.62 
 
 
292 aa  63.5  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  26.07 
 
 
291 aa  63.5  4e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  26.34 
 
 
294 aa  62  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  29.19 
 
 
188 aa  62  1e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  27.12 
 
 
249 aa  61.2  2e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  26.59 
 
 
245 aa  61.2  2e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  25.98 
 
 
293 aa  60.8  3e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  28.9 
 
 
190 aa  59.7  5e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  25.99 
 
 
189 aa  59.7  5e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  28.57 
 
 
188 aa  59.7  5e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  25.42 
 
 
189 aa  58.9  9e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.9  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  26.55 
 
 
189 aa  58.9  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  25.99 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  26.55 
 
 
189 aa  58.2  2e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  25.27 
 
 
193 aa  57  3e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>