19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0435 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  636  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  6.27827e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  28.83 
 
 
350 aa  139  5e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  29.28 
 
 
344 aa  137  3e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2755  hypothetical protein  26.83 
 
 
339 aa  133  4e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  27.14 
 
 
346 aa  133  4e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  30.52 
 
 
365 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  26.18 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  23.88 
 
 
346 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  24.2 
 
 
348 aa  60.8  3e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  24.75 
 
 
392 aa  56.2  6e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  27.31 
 
 
376 aa  55.8  9e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  24.59 
 
 
400 aa  53.5  4e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  24.78 
 
 
355 aa  53.5  4e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  24.24 
 
 
351 aa  52.8  9e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  26.64 
 
 
386 aa  52.4  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  25.49 
 
 
346 aa  50.4  4e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  23.12 
 
 
344 aa  49.3  9e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  6.6418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  24.25 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  20.17 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>