23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3807 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  87.4 
 
 
254 aa  451  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  65.96 
 
 
236 aa  326  2e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  44.27 
 
 
253 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  40.48 
 
 
253 aa  173  2e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  40.48 
 
 
253 aa  173  2e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  40.48 
 
 
253 aa  173  3e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  36.18 
 
 
252 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  36.89 
 
 
253 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  36.11 
 
 
261 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  34.66 
 
 
266 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  34.08 
 
 
267 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  32.05 
 
 
267 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  36.41 
 
 
309 aa  121  1e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  27.06 
 
 
261 aa  84.3  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  24.62 
 
 
263 aa  58.9  8e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  27.38 
 
 
260 aa  57.8  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  27.4 
 
 
260 aa  53.9  3e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  24.89 
 
 
275 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  24.89 
 
 
275 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  24.89 
 
 
265 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  20.72 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  24.46 
 
 
260 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>