20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2439 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  91.74 
 
 
242 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  66.53 
 
 
242 aa  343  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  56.61 
 
 
242 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  57.02 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  55.79 
 
 
242 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  45.04 
 
 
241 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  44.21 
 
 
238 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  45.04 
 
 
239 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  44.21 
 
 
239 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  43.39 
 
 
239 aa  201  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  35.77 
 
 
243 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  34.15 
 
 
237 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  31.82 
 
 
245 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  32.23 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  32.52 
 
 
249 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  29.51 
 
 
235 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  31.58 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  31.22 
 
 
250 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  29.09 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>