21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1893 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1893  CBS  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  42.44 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  41.5 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  40.91 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  40.59 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.59 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  35.8 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  35.23 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  36.08 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  47.37 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  32.77 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  30.52 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  32.1 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  29.17 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  28.05 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>