More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0204 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  87.29 
 
 
354 aa  654  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
354 aa  734  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  84.7 
 
 
354 aa  630  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  83.29 
 
 
354 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  83.9 
 
 
354 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  80.74 
 
 
354 aa  594  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  80.23 
 
 
354 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.4 
 
 
354 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.68 
 
 
354 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.38 
 
 
354 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.66 
 
 
354 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.68 
 
 
354 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  78.75 
 
 
354 aa  583  1e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.4 
 
 
354 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.4 
 
 
354 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.4 
 
 
354 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  79.04 
 
 
370 aa  582  1e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.4 
 
 
354 aa  582  1e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  77.62 
 
 
354 aa  574  1e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
354 aa  575  1e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  77.34 
 
 
354 aa  572  1e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.14 
 
 
354 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.99 
 
 
354 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.86 
 
 
354 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.55 
 
 
354 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.86 
 
 
354 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  8.79946e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0361  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.6 
 
 
354 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000396687 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.01 
 
 
354 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.45 
 
 
354 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.73 
 
 
354 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.9 
 
 
354 aa  534  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.93 
 
 
354 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  66.67 
 
 
359 aa  506  1e-142  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  69.34 
 
 
354 aa  507  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.08 
 
 
354 aa  507  1e-142  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.05 
 
 
354 aa  506  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.27 
 
 
354 aa  507  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.91 
 
 
354 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.91 
 
 
357 aa  501  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.8 
 
 
354 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.19 
 
 
354 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.8 
 
 
354 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.8 
 
 
354 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  68.77 
 
 
354 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 
354 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.23 
 
 
359 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.23 
 
 
359 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 
359 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.8 
 
 
354 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  68.7 
 
 
345 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 
359 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 
354 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.25 
 
 
345 aa  491  1e-138  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.80725e-05  decreased coverage  7.6105e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.27 
 
 
354 aa  491  1e-138  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
363 aa  492  1e-138  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.38 
 
 
354 aa  492  1e-138  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
363 aa  492  1e-138  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.97 
 
 
359 aa  493  1e-138  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 
357 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.67 
 
 
357 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.95 
 
 
357 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.67 
 
 
357 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0797  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 
357 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.162751  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1857  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 
357 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  67.91 
 
 
356 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  67.91 
 
 
356 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.69 
 
 
354 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.90228e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
354 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  65.62 
 
 
354 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.97 
 
 
354 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.29 
 
 
355 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08011  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 
357 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0594842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.82 
 
 
354 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
354 aa  478  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
354 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
354 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
354 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  64.57 
 
 
355 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
355 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.02 
 
 
345 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.47 
 
 
354 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.12 
 
 
354 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.12 
 
 
354 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
355 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>