More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2278 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
752 aa  1513    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  64.71 
 
 
762 aa  948    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  62.36 
 
 
777 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  60.52 
 
 
771 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  60.89 
 
 
774 aa  328  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.15 
 
 
622 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 
587 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 
357 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
602 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
415 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 
621 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
490 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
861 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
642 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  39.85 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
499 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
652 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
646 aa  160  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  37.73 
 
 
457 aa  160  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 
650 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  39.03 
 
 
505 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
437 aa  158  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  39.5 
 
 
653 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
457 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.01 
 
 
666 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
687 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
615 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.24 
 
 
638 aa  150  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  34.16 
 
 
500 aa  147  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.98 
 
 
593 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
486 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
551 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  34.51 
 
 
475 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.86 
 
 
662 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 
1198 aa  138  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.73 
 
 
591 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  34.58 
 
 
620 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.82 
 
 
579 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
628 aa  137  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  32.2 
 
 
662 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
646 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  33.33 
 
 
485 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1668  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
431 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
332 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  34.32 
 
 
461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  36.23 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
776 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  30.58 
 
 
692 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.16 
 
 
696 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
673 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.22 
 
 
880 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.13 
 
 
863 aa  131  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.36 
 
 
632 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 
667 aa  130  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.79 
 
 
604 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.6 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.62 
 
 
647 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
1430 aa  129  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  32.04 
 
 
609 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
700 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.95 
 
 
406 aa  127  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 
715 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
651 aa  127  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
528 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.68 
 
 
603 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 
526 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
612 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
590 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
746 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.27 
 
 
658 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.04 
 
 
916 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 
1435 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  30.43 
 
 
621 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.92 
 
 
623 aa  125  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  30.8 
 
 
625 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2336  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
414 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2285  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
414 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.05 
 
 
700 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
612 aa  124  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
615 aa  124  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
457 aa  124  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
398 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
398 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
398 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.83 
 
 
618 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
619 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.23 
 
 
602 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.45 
 
 
869 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
450 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
625 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 
439 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  32.25 
 
 
597 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>