23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1241 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  2.32118e-08 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  63.51 
 
 
220 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  63.51 
 
 
220 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  63.35 
 
 
216 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  63.96 
 
 
220 aa  253  1e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  62.61 
 
 
220 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  55.31 
 
 
223 aa  220  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  41.12 
 
 
212 aa  135  7e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  56.12 
 
 
143 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  53.19 
 
 
145 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  64.63 
 
 
89 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  1.75361e-08 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  53.06 
 
 
143 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  56.47 
 
 
96 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  56.47 
 
 
96 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  50.53 
 
 
145 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  54.12 
 
 
96 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  47.06 
 
 
97 aa  83.2  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4892  hypothetical protein  32.76 
 
 
197 aa  80.9  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  29.68 
 
 
195 aa  73.9  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  57.63 
 
 
66 aa  70.1  3e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0913  hypothetical protein  30.38 
 
 
173 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.514761  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0809  hypothetical protein  29.52 
 
 
170 aa  57.8  1e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5244  hypothetical protein  30.45 
 
 
177 aa  54.7  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>