19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0032 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  78.91 
 
 		 258 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.37 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.66 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  71.81 
 
 		 259 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  75.49 
 
 		 262 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  72.2 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.18 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.67 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  32.12 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.43 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.43 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.14 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  29.9 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.84 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  26.81 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>