75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4092 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4092  phosphonate metabolism PhnJ  100 
 
 
293 aa  611  1e-174  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  0.0436641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3828  phosphonate metabolism PhnJ  96.25 
 
 
293 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1283  phosphonate metabolism PhnJ  91.07 
 
 
293 aa  553  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5845  putative PhnJ protein, phosphonate metabolism  91.44 
 
 
294 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0759  phosphonate metabolism PhnJ  88.19 
 
 
292 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1313  phosphonate metabolism PhnJ  82.01 
 
 
299 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2911  phosphonate metabolism PhnJ  83.75 
 
 
295 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.946533  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0273  hypothetical protein  81.34 
 
 
302 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4232  phosphonate metabolism PhnJ  81.21 
 
 
297 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4210  phosphonate metabolism PhnJ  82.73 
 
 
296 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2193  phosphonate metabolism PhnJ  81.59 
 
 
297 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4121  phosphonate metabolism PhnJ  81.52 
 
 
291 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4435  phosphonate metabolism PhnJ  81.52 
 
 
291 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734305  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4779  phosphonate metabolism PhnJ  77.82 
 
 
290 aa  470  1e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0683801  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3854  phosphonate metabolism PhnJ  79.93 
 
 
295 aa  466  1e-130  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0578  phosphonate metabolism PhnJ  76.62 
 
 
301 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3700  phosphonate metabolism PhnJ  78.26 
 
 
293 aa  460  1e-128  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.501076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0482  phosphonate metabolism PhnJ  76.98 
 
 
301 aa  460  1e-128  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0302  phosphonate metabolism PhnJ  77.78 
 
 
281 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5611  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.78 
 
 
281 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3893  phosphonate metabolism PhnJ  77.78 
 
 
281 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3928  phosphonate metabolism PhnJ  77.41 
 
 
281 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4339  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.41 
 
 
281 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03930  hypothetical protein  77.41 
 
 
281 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4652  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.41 
 
 
281 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03970  carbon-phosphorus lyase complex subunit  77.41 
 
 
281 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2691  phosphonate metabolism PhnJ  75.55 
 
 
284 aa  453  1e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3331  PhnJ protein, phosphonate metabolism, function unknown  70.69 
 
 
318 aa  452  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4564  phosphonate metabolism protein PhnJ  76.67 
 
 
281 aa  453  1e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20390  hypothetical protein  74.55 
 
 
294 aa  451  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168153  normal  0.830655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0518  phosphonate metabolism PhnJ  76.1 
 
 
286 aa  451  1e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2883  phosphonate metabolism PhnJ  75.46 
 
 
289 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409915  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1752  hypothetical protein  76.1 
 
 
293 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2921  phosphonate metabolism PhnJ  75.65 
 
 
305 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2254  phosphonate metabolism PhnJ  76.1 
 
 
295 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00439967  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2562  phosphonate metabolism protein PhnJ  76.1 
 
 
295 aa  447  1e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0890  phosphonate metabolism PhnJ  75.19 
 
 
284 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0816  phosphonate metabolism PhnJ  78.34 
 
 
284 aa  438  1e-122  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0763  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.19 
 
 
295 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00284174  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6095  phosphonate metabolism PhnJ  74.22 
 
 
299 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4189  phosphonate metabolism PhnJ  74.44 
 
 
293 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3563  phosphonate metabolism protein PhnJ  76.32 
 
 
293 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1311  phosphonate metabolism PhnJ  76.3 
 
 
283 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0677348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4028  PhnJ protein  75.94 
 
 
293 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3697  phosphonate metabolism PhnJ  75.94 
 
 
293 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2960  phosphonate metabolism PhnJ  75.19 
 
 
326 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2182  putative phosphonate metabolism PhnJ protein  71.43 
 
 
313 aa  414  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260879  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0142  phosphonate metabolism PhnJ  70.46 
 
 
307 aa  415  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5943  phosphonate metabolism PhnJ  71.48 
 
 
310 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3776  phosphonate metabolism PhnJ  70.44 
 
 
302 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2914  phosphonate metabolism PhnJ  73.7 
 
 
277 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnJ  72.22 
 
 
324 aa  404  1e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3308  phosphonate metabolism protein PhnJ  72.59 
 
 
324 aa  405  1e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0319  phosphonate metabolism protein PhnJ  72.22 
 
 
324 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2589  phosphonate metabolism protein PhnJ  72.22 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1180  phosphonate metabolism protein PhnJ  72.22 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3342  phosphonate metabolism protein PhnJ  72.22 
 
 
324 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1928  phosphonate metabolism PhnJ  67.41 
 
 
274 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2281  phosphonate metabolism protein PhnJ  67.41 
 
 
274 aa  378  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0231  phosphonate metabolism PhnJ  54.01 
 
 
335 aa  318  8e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.713809  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3789  phosphonate metabolism PhnJ  52.1 
 
 
289 aa  311  6e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3840  phosphonate metabolism PhnJ  52.1 
 
 
289 aa  311  7e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5000  phosphonate metabolism PhnJ  52.26 
 
 
315 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00558671  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2293  phosphonate metabolism protein PhnJ  54.12 
 
 
299 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4040  phosphonate metabolism PhnJ  53.36 
 
 
299 aa  303  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0220  phosphonate metabolism PhnJ  53.36 
 
 
299 aa  303  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2085  phosphonate metabolism PhnJ  50 
 
 
308 aa  303  3e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3689  phosphonate metabolism PhnJ  52.55 
 
 
308 aa  303  3e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1588  phosphonate metabolism PhnJ  52.17 
 
 
288 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2292  phosphonate metabolism PhnJ  51.2 
 
 
302 aa  285  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4146  phosphonate metabolism PhnJ  50.86 
 
 
302 aa  284  1e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3509  phosphonate metabolism PhnJ  53.45 
 
 
288 aa  281  6e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0427  phosphonate metabolism protein  48.01 
 
 
299 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0463  phosphonate metabolism protein  48.01 
 
 
299 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.343412  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5870  phosphonate metabolism PhnJ  47.96 
 
 
293 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>