75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4779 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4779  phosphonate metabolism PhnJ  100 
 
 		 290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0683801  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3700  phosphonate metabolism PhnJ  81.29 
 
 		 293 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.501076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3828  phosphonate metabolism PhnJ  77.82 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4232  phosphonate metabolism PhnJ  78.17 
 
 		 297 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4092  phosphonate metabolism PhnJ  77.82 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  0.0436641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2193  phosphonate metabolism PhnJ  78.17 
 
 		 297 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1313  phosphonate metabolism PhnJ  77.78 
 
 		 299 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0273  hypothetical protein  78.78 
 
 		 302 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5845  putative PhnJ protein, phosphonate metabolism  76.9 
 
 		 294 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4121  phosphonate metabolism PhnJ  76.06 
 
 		 291 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1283  phosphonate metabolism PhnJ  75.7 
 
 		 293 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4435  phosphonate metabolism PhnJ  75.7 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2911  phosphonate metabolism PhnJ  77.62 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.946533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4210  phosphonate metabolism PhnJ  77.98 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3331  PhnJ protein, phosphonate metabolism, function unknown  71.13 
 
 		 318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0759  phosphonate metabolism PhnJ  76.51 
 
 		 292 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0302  phosphonate metabolism PhnJ  76.4 
 
 		 281 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3893  phosphonate metabolism PhnJ  76.03 
 
 		 281 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5611  phosphonate metabolism protein PhnJ  76.03 
 
 		 281 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0482  phosphonate metabolism PhnJ  73.29 
 
 		 301 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0578  phosphonate metabolism PhnJ  72.92 
 
 		 301 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2562  phosphonate metabolism protein PhnJ  74.29 
 
 		 295 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3928  phosphonate metabolism PhnJ  75.66 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03970  carbon-phosphorus lyase complex subunit  75.66 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2691  phosphonate metabolism PhnJ  73.38 
 
 		 284 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03930  hypothetical protein  75.66 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2254  phosphonate metabolism PhnJ  74.29 
 
 		 295 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00439967  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4564  phosphonate metabolism protein PhnJ  74.91 
 
 		 281 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0518  phosphonate metabolism PhnJ  74.73 
 
 		 286 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4652  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.66 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4339  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.66 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2883  phosphonate metabolism PhnJ  75.56 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3854  phosphonate metabolism PhnJ  76.43 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0890  phosphonate metabolism PhnJ  72.73 
 
 		 284 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2921  phosphonate metabolism PhnJ  72.18 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20390  hypothetical protein  73.48 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168153  normal  0.830655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1752  hypothetical protein  73.82 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0763  phosphonate metabolism protein PhnJ  73.53 
 
 		 295 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1311  phosphonate metabolism PhnJ  73.72 
 
 		 283 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0677348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3697  phosphonate metabolism PhnJ  74.91 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4028  PhnJ protein  74.91 
 
 		 293 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5943  phosphonate metabolism PhnJ  70.96 
 
 		 310 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4189  phosphonate metabolism PhnJ  70.8 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3563  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.28 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6095  phosphonate metabolism PhnJ  74.82 
 
 		 299 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3776  phosphonate metabolism PhnJ  70.29 
 
 		 302 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2182  putative phosphonate metabolism PhnJ protein  70.8 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260879  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0816  phosphonate metabolism PhnJ  74.44 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0142  phosphonate metabolism PhnJ  69.04 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2960  phosphonate metabolism PhnJ  71.85 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnJ  70.33 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0319  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.33 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3308  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.33 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1180  phosphonate metabolism protein PhnJ  69.96 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2914  phosphonate metabolism PhnJ  71.69 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3342  phosphonate metabolism protein PhnJ  69.96 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2589  phosphonate metabolism protein PhnJ  69.96 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1928  phosphonate metabolism PhnJ  62.73 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2281  phosphonate metabolism protein PhnJ  62.73 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0231  phosphonate metabolism PhnJ  54.18 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.713809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3789  phosphonate metabolism PhnJ  51.06 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3840  phosphonate metabolism PhnJ  51.06 
 
 		 289 aa  294  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5000  phosphonate metabolism PhnJ  50.53 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4146  phosphonate metabolism PhnJ  52.46 
 
 		 302 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2293  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.73 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2292  phosphonate metabolism PhnJ  53.41 
 
 		 302 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0220  phosphonate metabolism PhnJ  49.48 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4040  phosphonate metabolism PhnJ  49.48 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2085  phosphonate metabolism PhnJ  49.45 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1588  phosphonate metabolism PhnJ  51.25 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3689  phosphonate metabolism PhnJ  48.07 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3509  phosphonate metabolism PhnJ  52.69 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0427  phosphonate metabolism protein  49.28 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0463  phosphonate metabolism protein  49.28 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.343412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5870  phosphonate metabolism PhnJ  48.33 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>