75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0273 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4232  phosphonate metabolism PhnJ  91.93 
 
 		 297 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4435  phosphonate metabolism PhnJ  92.25 
 
 		 291 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4121  phosphonate metabolism PhnJ  91.2 
 
 		 291 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2193  phosphonate metabolism PhnJ  86.52 
 
 		 297 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1313  phosphonate metabolism PhnJ  82.93 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3828  phosphonate metabolism PhnJ  81.6 
 
 		 293 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4210  phosphonate metabolism PhnJ  84.84 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2911  phosphonate metabolism PhnJ  82.75 
 
 		 295 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.946533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5845  putative PhnJ protein, phosphonate metabolism  84.84 
 
 		 294 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1283  phosphonate metabolism PhnJ  81.05 
 
 		 293 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4092  phosphonate metabolism PhnJ  81.34 
 
 		 293 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  0.0436641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3854  phosphonate metabolism PhnJ  83.7 
 
 		 295 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0578  phosphonate metabolism PhnJ  75.97 
 
 		 301 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0518  phosphonate metabolism PhnJ  76.34 
 
 		 286 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4779  phosphonate metabolism PhnJ  78.78 
 
 		 290 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0683801  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3700  phosphonate metabolism PhnJ  77.94 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.501076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0759  phosphonate metabolism PhnJ  79.24 
 
 		 292 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0482  phosphonate metabolism PhnJ  75.62 
 
 		 301 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2691  phosphonate metabolism PhnJ  74.91 
 
 		 284 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3928  phosphonate metabolism PhnJ  77.41 
 
 		 281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5611  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.41 
 
 		 281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4652  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.41 
 
 		 281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4339  phosphonate metabolism protein PhnJ  77.41 
 
 		 281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03930  hypothetical protein  77.41 
 
 		 281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3893  phosphonate metabolism PhnJ  77.41 
 
 		 281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0302  phosphonate metabolism PhnJ  78.15 
 
 		 281 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03970  carbon-phosphorus lyase complex subunit  77.41 
 
 		 281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3331  PhnJ protein, phosphonate metabolism, function unknown  72.03 
 
 		 318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4564  phosphonate metabolism protein PhnJ  76.67 
 
 		 281 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0890  phosphonate metabolism PhnJ  74.01 
 
 		 284 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2562  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.46 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2254  phosphonate metabolism PhnJ  75.46 
 
 		 295 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00439967  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2883  phosphonate metabolism PhnJ  72.24 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2921  phosphonate metabolism PhnJ  75.56 
 
 		 305 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20390  hypothetical protein  73.29 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168153  normal  0.830655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1752  hypothetical protein  74.26 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3563  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.46 
 
 		 293 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0816  phosphonate metabolism PhnJ  74.91 
 
 		 284 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1311  phosphonate metabolism PhnJ  74.01 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0677348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3697  phosphonate metabolism PhnJ  75.09 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4028  PhnJ protein  75.09 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0763  phosphonate metabolism protein PhnJ  75.09 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6095  phosphonate metabolism PhnJ  75.93 
 
 		 299 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4189  phosphonate metabolism PhnJ  71.17 
 
 		 293 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5943  phosphonate metabolism PhnJ  66.32 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2182  putative phosphonate metabolism PhnJ protein  66.67 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260879  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0142  phosphonate metabolism PhnJ  68.79 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2960  phosphonate metabolism PhnJ  74.06 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3776  phosphonate metabolism PhnJ  68.5 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2589  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.11 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1180  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.11 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2914  phosphonate metabolism PhnJ  71.48 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3342  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.11 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3308  phosphonate metabolism protein PhnJ  70.48 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnJ  69.74 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0319  phosphonate metabolism protein PhnJ  69.74 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1928  phosphonate metabolism PhnJ  65.56 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2281  phosphonate metabolism protein PhnJ  65.56 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0231  phosphonate metabolism PhnJ  56.55 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.713809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5000  phosphonate metabolism PhnJ  53.36 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0220  phosphonate metabolism PhnJ  50.67 
 
 		 299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4040  phosphonate metabolism PhnJ  50.67 
 
 		 299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3789  phosphonate metabolism PhnJ  50.17 
 
 		 289 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3840  phosphonate metabolism PhnJ  50.17 
 
 		 289 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1588  phosphonate metabolism PhnJ  53.62 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3689  phosphonate metabolism PhnJ  51.09 
 
 		 308 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0463  phosphonate metabolism protein  51.05 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.343412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0427  phosphonate metabolism protein  51.05 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2085  phosphonate metabolism PhnJ  48.78 
 
 		 308 aa  298  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2292  phosphonate metabolism PhnJ  52.98 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2293  phosphonate metabolism protein PhnJ  51.05 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4146  phosphonate metabolism PhnJ  52.63 
 
 		 302 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3509  phosphonate metabolism PhnJ  53.45 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5870  phosphonate metabolism PhnJ  48.33 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>