75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5000 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5000  phosphonate metabolism PhnJ  100 
 
 
315 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00558671  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3789  phosphonate metabolism PhnJ  76.87 
 
 
289 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3840  phosphonate metabolism PhnJ  76.51 
 
 
289 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4040  phosphonate metabolism PhnJ  71.97 
 
 
299 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0220  phosphonate metabolism PhnJ  71.97 
 
 
299 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2085  phosphonate metabolism PhnJ  71.53 
 
 
308 aa  431  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2293  phosphonate metabolism protein PhnJ  71.33 
 
 
299 aa  427  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0427  phosphonate metabolism protein  71.28 
 
 
299 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0463  phosphonate metabolism protein  71.28 
 
 
299 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.343412  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3689  phosphonate metabolism PhnJ  70.32 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2292  phosphonate metabolism PhnJ  67.38 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4146  phosphonate metabolism PhnJ  67.26 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0231  phosphonate metabolism PhnJ  55.91 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.713809  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0273  hypothetical protein  53.36 
 
 
302 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2254  phosphonate metabolism PhnJ  52.7 
 
 
295 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00439967  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2883  phosphonate metabolism PhnJ  53.5 
 
 
289 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409915  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1283  phosphonate metabolism PhnJ  53.96 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2562  phosphonate metabolism protein PhnJ  54.48 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0518  phosphonate metabolism PhnJ  51.41 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3893  phosphonate metabolism PhnJ  53.85 
 
 
281 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5611  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.85 
 
 
281 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4339  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.85 
 
 
281 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03930  hypothetical protein  53.85 
 
 
281 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3928  phosphonate metabolism PhnJ  53.85 
 
 
281 aa  311  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03970  carbon-phosphorus lyase complex subunit  53.85 
 
 
281 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4652  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.85 
 
 
281 aa  311  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2921  phosphonate metabolism PhnJ  54.41 
 
 
305 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2691  phosphonate metabolism PhnJ  53.28 
 
 
284 aa  310  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4210  phosphonate metabolism PhnJ  52.9 
 
 
296 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3828  phosphonate metabolism PhnJ  52.26 
 
 
293 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4435  phosphonate metabolism PhnJ  53.45 
 
 
291 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734305  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2193  phosphonate metabolism PhnJ  54.01 
 
 
297 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4564  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.11 
 
 
281 aa  308  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20390  hypothetical protein  53.19 
 
 
294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168153  normal  0.830655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1752  hypothetical protein  54.74 
 
 
293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0578  phosphonate metabolism PhnJ  48.87 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2911  phosphonate metabolism PhnJ  51.97 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.946533  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4121  phosphonate metabolism PhnJ  53.45 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1313  phosphonate metabolism PhnJ  53.62 
 
 
299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981243  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4232  phosphonate metabolism PhnJ  53.28 
 
 
297 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4189  phosphonate metabolism PhnJ  51.4 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4092  phosphonate metabolism PhnJ  52.26 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  0.0436641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5845  putative PhnJ protein, phosphonate metabolism  53.6 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0302  phosphonate metabolism PhnJ  52.75 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3776  phosphonate metabolism PhnJ  53.11 
 
 
302 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3331  PhnJ protein, phosphonate metabolism, function unknown  51.21 
 
 
318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0482  phosphonate metabolism PhnJ  50.52 
 
 
301 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1588  phosphonate metabolism PhnJ  53.36 
 
 
288 aa  300  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0890  phosphonate metabolism PhnJ  52.01 
 
 
284 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5943  phosphonate metabolism PhnJ  52.92 
 
 
310 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1311  phosphonate metabolism PhnJ  51.59 
 
 
283 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0677348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2182  putative phosphonate metabolism PhnJ protein  52.19 
 
 
313 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260879  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0763  phosphonate metabolism protein PhnJ  50.35 
 
 
295 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00284174  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3854  phosphonate metabolism PhnJ  51.97 
 
 
295 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6095  phosphonate metabolism PhnJ  52.73 
 
 
299 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3563  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.01 
 
 
293 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4779  phosphonate metabolism PhnJ  50.53 
 
 
290 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0683801  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0142  phosphonate metabolism PhnJ  52.19 
 
 
307 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2960  phosphonate metabolism PhnJ  50.68 
 
 
326 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3697  phosphonate metabolism PhnJ  52.01 
 
 
293 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3308  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.28 
 
 
324 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4028  PhnJ protein  52.01 
 
 
293 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1180  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.92 
 
 
324 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3342  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.92 
 
 
324 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2589  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.92 
 
 
324 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0319  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.55 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0759  phosphonate metabolism PhnJ  51.23 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnJ  52.55 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0816  phosphonate metabolism PhnJ  52.73 
 
 
284 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3700  phosphonate metabolism PhnJ  49.09 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.501076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3509  phosphonate metabolism PhnJ  52.76 
 
 
288 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2914  phosphonate metabolism PhnJ  52 
 
 
277 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2281  phosphonate metabolism protein PhnJ  48.54 
 
 
274 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1928  phosphonate metabolism PhnJ  48.54 
 
 
274 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5870  phosphonate metabolism PhnJ  42.71 
 
 
293 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>