40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3923 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  68.45 
 
 		 168 aa  240  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  63.1 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  56.55 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  53.57 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  50.6 
 
 		 190 aa  170  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  49.43 
 
 		 176 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  42.48 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  30.72 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  38.18 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  32.47 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  35.03 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  36.7 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  38.56 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  33.91 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  40.32 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  33.86 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  33.88 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  38.78 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  31.9 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  34.39 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  33.76 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  33.93 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  30 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  33.87 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  32.76 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  29.84 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  33.93 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.76 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  30.33 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  26.23 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  31.19 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  30.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  25.29 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  22.12 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  22.12 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>