203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1097 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  98.42 
 
 
253 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  94.47 
 
 
253 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  87.35 
 
 
252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  58.87 
 
 
255 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  60.48 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  61.26 
 
 
261 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  44.83 
 
 
270 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  43.3 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  43.24 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  45.53 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.38 
 
 
283 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  44.66 
 
 
275 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  44.62 
 
 
275 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  42.91 
 
 
275 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  43.94 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  43.94 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  43.56 
 
 
273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  43.94 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  43.18 
 
 
273 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.85 
 
 
271 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  42.8 
 
 
273 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  43.43 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  42.13 
 
 
278 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.27 
 
 
256 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.44 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.94 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  40.78 
 
 
617 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.71 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  40.83 
 
 
247 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  40.08 
 
 
361 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.63 
 
 
254 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.83 
 
 
274 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3400  siderophore-interacting protein  37.75 
 
 
255 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  37.4 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  35.2 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3474  siderophore-interacting protein  37.35 
 
 
255 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3404  siderophore-interacting protein  37.35 
 
 
255 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  36.61 
 
 
311 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  38.55 
 
 
278 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3508  siderophore-interacting protein  36.95 
 
 
255 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000266465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3570  siderophore-interacting protein  36.95 
 
 
255 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.416656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.52 
 
 
348 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  38.02 
 
 
297 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  40 
 
 
290 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.94 
 
 
254 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  36.07 
 
 
623 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  37.86 
 
 
304 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  43 
 
 
275 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  34.48 
 
 
284 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  36.89 
 
 
289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  38.84 
 
 
277 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  37.5 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  38.96 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  34.8 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  42.67 
 
 
289 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  36.84 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  34.27 
 
 
257 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  36.99 
 
 
280 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  37.04 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.14 
 
 
274 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  36.1 
 
 
250 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  32.85 
 
 
340 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  34.68 
 
 
272 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  36.1 
 
 
250 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.22 
 
 
277 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.26 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  35.68 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.45 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.68 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  31.15 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  35.1 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.41 
 
 
275 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.87 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.03 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  31.8 
 
 
291 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  32.35 
 
 
234 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  35.91 
 
 
276 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.79 
 
 
277 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  31.98 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  31.5 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  36.4 
 
 
354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
273 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09730  siderophore-interacting protein  32.8 
 
 
300 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.222844  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  33.47 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  31.84 
 
 
272 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>