More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5170 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  73.16 
 
 
476 aa  702  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  967  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  72.07 
 
 
475 aa  677  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  70.19 
 
 
476 aa  689  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  88.03 
 
 
480 aa  865  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  84.87 
 
 
476 aa  806  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  75.49 
 
 
476 aa  723  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  70.84 
 
 
476 aa  694  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  84.87 
 
 
474 aa  816  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  60.43 
 
 
481 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.63 
 
 
474 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
474 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
474 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 
476 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  53.35 
 
 
479 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
474 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
475 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
474 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  53.9 
 
 
474 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
474 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  53.29 
 
 
474 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.21 
 
 
479 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  53.19 
 
 
474 aa  516  1e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
485 aa  515  1e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
474 aa  515  1e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 
473 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
471 aa  506  1e-142  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
475 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  51.61 
 
 
473 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
475 aa  465  1e-130  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
490 aa  465  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.27 
 
 
472 aa  467  1e-130  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
478 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
480 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
480 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
480 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
480 aa  461  1e-128  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
480 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
480 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  49.55 
 
 
487 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  51.09 
 
 
477 aa  453  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  50.97 
 
 
473 aa  453  1e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
473 aa  446  1e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.87 
 
 
472 aa  448  1e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
470 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  50.22 
 
 
472 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  49.11 
 
 
511 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
490 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  51.73 
 
 
467 aa  441  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  48.67 
 
 
480 aa  439  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 
475 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  48.11 
 
 
483 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
476 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
510 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  50.56 
 
 
491 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
475 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  50.66 
 
 
466 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
491 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
491 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
476 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  45.81 
 
 
462 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  50.68 
 
 
465 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  50 
 
 
470 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
484 aa  416  1e-115  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
480 aa  416  1e-115  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  45.37 
 
 
469 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
460 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
479 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 
470 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  48.46 
 
 
474 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  48.38 
 
 
496 aa  407  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  47.95 
 
 
481 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 
473 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  47.65 
 
 
498 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  49.3 
 
 
478 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
477 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  44.97 
 
 
479 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  43.31 
 
 
479 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
483 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
477 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  42.31 
 
 
472 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  46.78 
 
 
469 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
472 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  46.49 
 
 
477 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
477 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  50.12 
 
 
481 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
465 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2120  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
474 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.536292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  41.06 
 
 
472 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  48.59 
 
 
477 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 
462 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
486 aa  356  6e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>