More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2328 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  97.59 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  96.39 
 
 		 166 aa  323  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  95.78 
 
 		 166 aa  321  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  84.94 
 
 		 166 aa  292  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  86.06 
 
 		 165 aa  284  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  85.45 
 
 		 165 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  82.53 
 
 		 166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  80.12 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  81.33 
 
 		 166 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  72.39 
 
 		 166 aa  244  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  71.95 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  70.06 
 
 		 167 aa  233  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  70.06 
 
 		 167 aa  233  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  66.87 
 
 		 166 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  71.08 
 
 		 166 aa  231  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  67.66 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  69.46 
 
 		 167 aa  228  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  67.66 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  67.66 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  67.66 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  67.66 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.66 
 
 		 166 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  65.06 
 
 		 166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  224  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  65.87 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  66.47 
 
 		 167 aa  223  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  66.47 
 
 		 167 aa  223  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  68.9 
 
 		 167 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  65.27 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  64.67 
 
 		 168 aa  221  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.02 
 
 		 165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  66.27 
 
 		 166 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  64.67 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  66.87 
 
 		 166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.87 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  65.87 
 
 		 167 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  64.67 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  65.87 
 
 		 167 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  65.87 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  65.06 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.25 
 
 		 187 aa  216  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  66.46 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.25 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  61.82 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.64 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  63.25 
 
 		 167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  63.25 
 
 		 167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  64.07 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  64.07 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  63.47 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  65.06 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  62.87 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  62.05 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  61.11 
 
 		 167 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  61.11 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.25 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  63.03 
 
 		 165 aa  204  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  61.82 
 
 		 164 aa  204  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  57.58 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  60.61 
 
 		 165 aa  200  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  55.76 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  56.97 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  58.79 
 
 		 168 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  56.36 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  55.76 
 
 		 166 aa  190  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  57.23 
 
 		 187 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  58.18 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  56.29 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  55.42 
 
 		 199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  56.02 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  58.79 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  55.76 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  56.02 
 
 		 165 aa  183  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  52.41 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  50.91 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2756  redoxin domain protein  51.52 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.12 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  52.83 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  56.02 
 
 		 165 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  51.53 
 
 		 197 aa  168  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1604  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.91 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0349  thiol peroxidase  48.15 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  51.55 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  46.39 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  47.59 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  47.59 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  45.78 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  46.99 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>