126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0389 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  97.53 
 
 		 335 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  97.53 
 
 		 324 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 324 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  91.36 
 
 		 324 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  82.1 
 
 		 324 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  81.48 
 
 		 324 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  81.79 
 
 		 324 aa  550  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  81.17 
 
 		 324 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  80.86 
 
 		 324 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  82.41 
 
 		 324 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  78.4 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  62.23 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  60.06 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  59.26 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  59.26 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  58.46 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  59.26 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000117305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  58.33 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  54.52 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  55.14 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000310497  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2760  serine/threonine protein kinase  55.56 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  56.35 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  53.41 
 
 		 350 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  54.08 
 
 		 344 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  53.96 
 
 		 342 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  54.38 
 
 		 347 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  54.06 
 
 		 327 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  52.19 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  54.72 
 
 		 329 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  53.45 
 
 		 348 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 		 346 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  51.41 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 		 343 aa  338  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 		 342 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  53.56 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  53.56 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  53.56 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  53.56 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  53.92 
 
 		 343 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  53.92 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  53.11 
 
 		 343 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  53.11 
 
 		 343 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  50.94 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  53.87 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  53.78 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  50.78 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  52.8 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  51.56 
 
 		 345 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  53.27 
 
 		 329 aa  331  8e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 		 340 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  53.61 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  52.8 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  51.72 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  51.7 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  52.66 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  51.2 
 
 		 346 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  51.19 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  52.19 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  52.19 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  50.9 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  49.71 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  50.45 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  49.53 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  50.47 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  51.2 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  48.9 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  50.77 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  47.65 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  55.67 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  47.65 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 328 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  47.96 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  44.41 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>