260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2943 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  100 
 
 		 324 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  76.4 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  74.07 
 
 		 326 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  73.46 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  71.25 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  71.25 
 
 		 323 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  70.94 
 
 		 323 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  72.98 
 
 		 323 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  73.44 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  70.94 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  66.25 
 
 		 328 aa  454  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  59.62 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  56.78 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  55.14 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  41.03 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  40.32 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  38.84 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  36.66 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  36.66 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  35.89 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  31.61 
 
 		 454 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  31.89 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.53 
 
 		 1138 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  29.19 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  41.33 
 
 		 850 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  37.72 
 
 		 859 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  34.32 
 
 		 258 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  39.75 
 
 		 870 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  36.14 
 
 		 858 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  38.36 
 
 		 830 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  37.11 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  38.06 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  39.19 
 
 		 847 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  35.48 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  38.82 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  25.91 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  36.77 
 
 		 857 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  35.44 
 
 		 870 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  34.78 
 
 		 852 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  37.75 
 
 		 852 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  34.87 
 
 		 863 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  39.24 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  34.87 
 
 		 877 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  31.17 
 
 		 847 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  36.18 
 
 		 834 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 854 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  34.81 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.84 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  44 
 
 		 448 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2384  diadenosine tetraphosphatase  28.57 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  28.78 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  32.67 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  33.71 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  33.81 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  24.68 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1362  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  31.13 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  28.65 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  33.14 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0918  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  41.33 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1112  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  30.46 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  32.89 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  32.89 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  28.06 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  29.59 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  32.24 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  35.79 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.61 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3856  diadenosine tetraphosphatase  33.1 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  26.17 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1796  metallophosphoesterase  43.06 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1324  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  29.8 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  24.52 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8809  metallophosphoesterase  35.35 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  24.36 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  26.01 
 
 		 1225 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  41.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  32.57 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  30.57 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  24.12 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2821  diadenosine tetraphosphatase  34.48 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  43.04 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2854  diadenosine tetraphosphatase  25.85 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  37.18 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3090  metallophosphoesterase  37.35 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108769  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3200  diadenosine tetraphosphatase  39.53 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.238496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3027  diadenosine tetraphosphatase  41.03 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>