14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2035 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  820    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  46.5 
 
 
316 aa  305  7e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  45.62 
 
 
313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  44.97 
 
 
307 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  37.03 
 
 
309 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  32.82 
 
 
303 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  31.42 
 
 
305 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  25.27 
 
 
767 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  24.31 
 
 
525 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  27.72 
 
 
626 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  23.55 
 
 
496 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  20.69 
 
 
545 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  26.32 
 
 
582 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  26.32 
 
 
549 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>