More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2945 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 425 aa  872    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  73.23 
 
 		 406 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  73.35 
 
 		 405 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  73.1 
 
 		 405 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  73.23 
 
 		 406 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  73.1 
 
 		 405 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  73.1 
 
 		 405 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  72.73 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  72.19 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  72.08 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  72.34 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  72.34 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  72.59 
 
 		 406 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  71.72 
 
 		 403 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  69.73 
 
 		 406 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  72.08 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  70.71 
 
 		 406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  70.99 
 
 		 409 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  68.64 
 
 		 413 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  69.87 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  68.78 
 
 		 405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  69.37 
 
 		 406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  69.11 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  68.61 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2494  aminotransferase  68.61 
 
 		 406 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  68.27 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  70.44 
 
 		 407 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  68.48 
 
 		 402 aa  562  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  68.21 
 
 		 402 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  63.59 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  64.86 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  61.62 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  60.51 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  58.97 
 
 		 393 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  58.67 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  58.54 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  58.97 
 
 		 393 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  57.51 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  57.5 
 
 		 408 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  56.07 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  55.81 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  59.23 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  57.95 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  58.88 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  56.19 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  55.84 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  53.89 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  56.38 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  54.94 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  57.25 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  54.03 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  54.73 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  54.22 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  55.36 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  55.1 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  55.87 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  53.75 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  55.3 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  56.12 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  55.05 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  55.36 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  55.36 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  54.4 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  55.1 
 
 		 407 aa  454  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  55.61 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  57.25 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  55.36 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  54.15 
 
 		 402 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  54.66 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  55.18 
 
 		 411 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  53.89 
 
 		 394 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  55.36 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  52.96 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  55.61 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  56.48 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  53.55 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  53.52 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  54.08 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  51.42 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  53.52 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  56.74 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  53.63 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  53.37 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  52.93 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  52.38 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  53.42 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  52.67 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1905  aspartate aminotransferase  53.16 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>