211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0714 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  72.19 
 
 
192 aa  300  6e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  72.19 
 
 
201 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.11 
 
 
205 aa  237  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.43 
 
 
216 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.67 
 
 
204 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.91 
 
 
193 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  56.08 
 
 
204 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.95 
 
 
193 aa  219  1e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.38 
 
 
192 aa  198  4e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  52.38 
 
 
207 aa  196  2e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  52.91 
 
 
207 aa  196  2e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 
192 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 
192 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.12 
 
 
192 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.19 
 
 
195 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.32 
 
 
192 aa  187  6e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  44.68 
 
 
192 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.21 
 
 
191 aa  185  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.54 
 
 
507 aa  179  3e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
192 aa  178  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 
507 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
197 aa  147  1e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 
197 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.45 
 
 
194 aa  138  4e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.32 
 
 
193 aa  135  3e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 
194 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
189 aa  127  9e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
197 aa  127  1e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 
196 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.45 
 
 
191 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.92 
 
 
191 aa  119  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.26 
 
 
191 aa  119  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
191 aa  119  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.45 
 
 
191 aa  119  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.26 
 
 
191 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.74 
 
 
191 aa  118  5e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.45 
 
 
191 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.45 
 
 
191 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
191 aa  114  7e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
192 aa  110  2e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
218 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  1.99345e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.65 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.54 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.41 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.62 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.09 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
195 aa  90.9  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.44 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.44 
 
 
193 aa  89  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.44 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.93 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.93 
 
 
193 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.93 
 
 
193 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  30.93 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
196 aa  83.2  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
233 aa  83.2  2e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  34.05 
 
 
195 aa  83.2  2e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 
206 aa  82  4e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.63 
 
 
206 aa  82  5e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.62 
 
 
196 aa  82  5e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
230 aa  80.5  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.25 
 
 
196 aa  80.5  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
256 aa  79.7  3e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
197 aa  79  4e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.43 
 
 
196 aa  78.2  7e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  42.99 
 
 
211 aa  77.8  9e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
199 aa  77  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.72 
 
 
197 aa  76.3  3e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
199 aa  75.9  4e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  37.04 
 
 
193 aa  75.1  5e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.52 
 
 
194 aa  74.3  1e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 
200 aa  73.6  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  28.76 
 
 
213 aa  73.2  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
197 aa  73.6  2e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 
195 aa  73.2  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  8.46124e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  32.12 
 
 
198 aa  71.6  6e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 
268 aa  71.2  7e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
263 aa  71.2  8e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
261 aa  70.9  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
259 aa  70.1  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
223 aa  69.7  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
259 aa  70.1  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
198 aa  68.9  4e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  31.29 
 
 
203 aa  68.2  7e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>