172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3948 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.78 
 
 
552 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  74.08 
 
 
548 aa  785    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  69.8 
 
 
543 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  62.82 
 
 
550 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  63.94 
 
 
550 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  63.57 
 
 
552 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  66.54 
 
 
570 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  69.8 
 
 
543 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  68.32 
 
 
543 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  66.55 
 
 
582 aa  713    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  67.77 
 
 
543 aa  725    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  69.8 
 
 
543 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  69.8 
 
 
543 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  68.32 
 
 
543 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  96.17 
 
 
548 aa  1035    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  68.32 
 
 
543 aa  744    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  63.75 
 
 
546 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  70.44 
 
 
548 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  100 
 
 
548 aa  1095    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.59 
 
 
552 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  68.61 
 
 
582 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  61.84 
 
 
552 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  68.14 
 
 
543 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  75.77 
 
 
549 aa  827    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  69.8 
 
 
543 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  62.78 
 
 
552 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.2 
 
 
562 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  56.58 
 
 
565 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.3 
 
 
561 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  51.5 
 
 
563 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  56.67 
 
 
568 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  51.88 
 
 
558 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.02 
 
 
552 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.93 
 
 
577 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  45.95 
 
 
559 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.83 
 
 
576 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.26 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  46.26 
 
 
556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  47.58 
 
 
553 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  45.13 
 
 
548 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  47.13 
 
 
553 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  39.93 
 
 
563 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  37.96 
 
 
565 aa  359  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.62 
 
 
565 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.4 
 
 
548 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  34.31 
 
 
557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  34.53 
 
 
548 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.34 
 
 
601 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  34.93 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  34.81 
 
 
558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  35.42 
 
 
560 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.2 
 
 
562 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.45 
 
 
553 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  33.95 
 
 
556 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  36.23 
 
 
547 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  35.57 
 
 
561 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.59 
 
 
548 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.59 
 
 
548 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  34.83 
 
 
578 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.44 
 
 
548 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  37.52 
 
 
561 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  36.75 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  34.51 
 
 
542 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  31.84 
 
 
535 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  36.94 
 
 
564 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  35.83 
 
 
555 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  29.47 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  35.54 
 
 
555 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  23.93 
 
 
537 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  23.52 
 
 
537 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.38 
 
 
567 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.62 
 
 
563 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.4 
 
 
566 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.37 
 
 
556 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.71 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.87 
 
 
541 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.81 
 
 
541 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.38 
 
 
541 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.9 
 
 
536 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.13 
 
 
643 aa  177  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.67 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.91 
 
 
636 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.69 
 
 
551 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  22.99 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  22.99 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.1 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  22.99 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  22.99 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  23.36 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  23.18 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25 
 
 
539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.51 
 
 
538 aa  163  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  22.99 
 
 
551 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  22.99 
 
 
551 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  22.8 
 
 
551 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>