20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3080 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  73.05 
 
 		 324 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  36 
 
 		 311 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  35.42 
 
 		 306 aa  84.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  34.87 
 
 		 308 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  40.96 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  34.69 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  27.4 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  32.91 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  30.72 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  32.22 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  27.63 
 
 		 299 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 301 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  38.96 
 
 		 294 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  36.04 
 
 		 375 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  43.48 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  30.82 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>