177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0728 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0728  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.198536  normal  0.463503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2496  siderophore-interacting protein  32.29 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  33.43 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  33.05 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3931  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  0.760126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.07 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  31.12 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  29.01 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4240  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  47.65 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  34.75 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  36.6 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  31.43 
 
 		 281 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  30.23 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  35.39 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  32.93 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.06 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  29.57 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  32 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  34.26 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  31.3 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  31.38 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.71 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.2 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  29.8 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.38 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.57 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.52 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  31.58 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.71 
 
 		 273 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.71 
 
 		 273 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  32 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.11 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  30.54 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.36 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.28 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  34.59 
 
 		 617 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.62 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  30.87 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  33.83 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.58 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  30.54 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.89 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.25 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  29.58 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  28.57 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.65 
 
 		 253 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  30.04 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  27.02 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.22 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.93 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.82 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1392  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.96 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0235893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.97 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  31.65 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.68 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.72 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.18 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  32.94 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.93 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  29.36 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.14 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  31.4 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.77 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  29.67 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  29.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  26.97 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  28.99 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.23 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  32.93 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2122  Siderophore-interacting protein  30.54 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  26.64 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26750  siderophore-interacting protein  28.1 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.27893  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.53 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.63 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  32.83 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  32.75 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  32.93 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  27.56 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  40.37 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  28.46 
 
 		 265 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.75 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  38.1 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2591  Siderophore-interacting protein  38.82 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000968447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4221  Siderophore-interacting protein  35.67 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>