58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0024 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  55 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  52.12 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  46.74 
 
 		 179 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  45.5 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  46.91 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.57 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  43.67 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  43.04 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  45.98 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  45.18 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  44.72 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  40.57 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  39.75 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  40.37 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  38.27 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  39.16 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  40 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  35.59 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  39.35 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  38.71 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  39.51 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  35.87 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  41.36 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  40.12 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  37.11 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  31.01 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  36.24 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  36.05 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  34.87 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  30.43 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  35.57 
 
 		 138 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  33.56 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  33.56 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  29.8 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  29.52 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  32.73 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  33.54 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  30.72 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  31.94 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  28.74 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  32.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  31.79 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  31.79 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  29.03 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  25.54 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.92 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>