147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0492 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 65 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  88.89 
 
 		 64 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0865  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.8068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0429  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3435  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.041073  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  45 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  44.26 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  40 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0764  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000255511  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3787  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0936197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1272  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3901  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00385077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04513  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00296689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0399  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0346  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.767822  decreased coverage  0.000256062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  40 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0850  50S ribosomal protein L29  43.75 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0328  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000164942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  41.27 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0211  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03163  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00161399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0401  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000919914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3697  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000365786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0477  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0320734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03114  hypothetical protein  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00150195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0286  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676877  hitchhiker  0.0000000263435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00738  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3506  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3795  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0401  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000329963  hitchhiker  0.0000645786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>