More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3065 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 289 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  37 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  32.25 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 343 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.05 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  33.47 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.08 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.64 
 
 		 321 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  34.42 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  31.6 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  31.44 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.99 
 
 		 326 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  31 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  31 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  33.04 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  31 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  31 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  31 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  31 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  36.1 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  51.96 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  43.7 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 358 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  42.97 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  46.02 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0715  galactosyltransferase  27.79 
 
 		 486 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.84 
 
 		 970 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  48.21 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  46.6 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  51.92 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1244  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0087282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  48.51 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  30.67 
 
 		 346 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.32 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  50.47 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.18 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  40.98 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  45.05 
 
 		 326 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  44.14 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  44.74 
 
 		 376 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 347 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1432  galactosyltransferase  28.18 
 
 		 569 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000251075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  44.14 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1240  glycosyltransferase  29.31 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000000212379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  48.39 
 
 		 1148 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  48.51 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  47.27 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  47.52 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 597 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  45 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  41.59 
 
 		 1157 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.04 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  46.53 
 
 		 398 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 1116 aa  99.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 		 380 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 341 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  28.77 
 
 		 697 aa  98.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.09 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.32 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.78 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  40.98 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 		 1301 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 354 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  42.28 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  39.85 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1242  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 389 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000038464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>