50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0052 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0052  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  100 
 
 		 357 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0114  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.42 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3894  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.84 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4334  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.7 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4279  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.7 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4098  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.56 
 
 		 357 aa  349  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3893  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.56 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3986  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.42 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4474  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  50.28 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4680  hypothetical protein  50.7 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4206  CDP-glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family protein  44.79 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0982  hypothetical protein  43.79 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0863  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  43.79 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00033  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  40.13 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00158752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04062  CDP-Glycerol:Poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase family  37.12 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3578  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.75 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0113  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  23.81 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3696  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  22.03 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1017  udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase protein  25.44 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.562201  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0642  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0340  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  26.32 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0981538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 777 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3616  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.49 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0163  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  22.37 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4693  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.49 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0495663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17900  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.57 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3931  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.77 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0114  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.39 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1736  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  33.7 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.872712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3149  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  27.21 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2261  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.71 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133563  hitchhiker  0.00246417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1694 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3733  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.94 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4321  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.79 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0565  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.85 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1294  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  26.11 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.103905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4200  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.19 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4249  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.19 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4131  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.19 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4146  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.19 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4308  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.19 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1131  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2601  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  23.16 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2748  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2901  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0067  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  21.94 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0510  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase protein  26.96 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23370  putative UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  22.32 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000715857  hitchhiker  0.0071335 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0423  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.25 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06751  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  25.25 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>