More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3733 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3733  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
369 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647438  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4321  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  85.48 
 
 
367 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3697  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  61 
 
 
369 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3974  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  60.11 
 
 
366 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0648  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  57.5 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711983  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2387  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  54.72 
 
 
391 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0541306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4249  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.02 
 
 
376 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4131  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.02 
 
 
376 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4308  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.02 
 
 
376 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4146  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.02 
 
 
376 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4200  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.02 
 
 
376 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3616  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.85 
 
 
420 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4000  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.61 
 
 
376 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.595097  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0160  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.56 
 
 
376 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4693  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.85 
 
 
420 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0495663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17900  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.77 
 
 
373 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0510  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase protein  53.12 
 
 
416 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151376  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0123  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
367 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3695  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  53.49 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1294  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.14 
 
 
369 aa  378  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1391  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.89 
 
 
380 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1946  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.54 
 
 
385 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1017  udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase protein  52.28 
 
 
379 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.562201  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4822  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.67 
 
 
374 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0514  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.29 
 
 
376 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0184  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.29 
 
 
376 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2601  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.67 
 
 
384 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4031  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.29 
 
 
376 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.898267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1489  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.65 
 
 
388 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1479  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  47.47 
 
 
378 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00228114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2261  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.81 
 
 
373 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133563  hitchhiker  0.00246417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0431  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.73 
 
 
394 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03664  UDP-N-acetyl glucosamine-2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.540179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4190  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03613  hypothetical protein  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4003  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4297  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0155  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.05 
 
 
381 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4466  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.49 
 
 
405 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.891229  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0699  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.48 
 
 
372 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5219  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.844383  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.47 
 
 
762 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4135  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0150  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.05 
 
 
381 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4150  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.43 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1811  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.62 
 
 
380 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1717  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.51 
 
 
381 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.632952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0441  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.32 
 
 
372 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4217  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.16 
 
 
376 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1413  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.05 
 
 
381 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00688736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4174  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.73 
 
 
384 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273419  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1316  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3778  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  52.72 
 
 
384 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0163  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  53.1 
 
 
376 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0854  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2966  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.55 
 
 
379 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000333079  normal  0.0786826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5473  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1335  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3620  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.14 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4893  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (UDP-GlcNAc-2-epimerase)  50.68 
 
 
371 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4964  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (UDP-GlcNAc-2-epimerase)  50.68 
 
 
371 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0123372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2185  UDP-GlcNAc 2-epimerase  49.05 
 
 
375 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.611942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2147  UDP-GlcNAc 2-epimerase  49.05 
 
 
375 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.71507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4993  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.1 
 
 
371 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5307  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.68 
 
 
371 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4878  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.68 
 
 
371 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1086  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.28 
 
 
376 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5289  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.68 
 
 
371 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000237497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0067  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.66 
 
 
373 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3132  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.21 
 
 
381 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5365  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.68 
 
 
371 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00689  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.39 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5048  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5433  udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0888  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.21 
 
 
378 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5117  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5359  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5509  udp-n-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3744  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.68 
 
 
371 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2461  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  47.06 
 
 
384 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2171  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  47.06 
 
 
384 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5320  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2146  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.75 
 
 
427 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5639  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
371 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000953753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3159  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.4 
 
 
383 aa  358  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0801  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.73 
 
 
371 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0120  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.13 
 
 
386 aa  358  8e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000198131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0429  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.45 
 
 
370 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0122439  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2748  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.78 
 
 
404 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2901  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.78 
 
 
404 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1131  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  48.78 
 
 
404 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0642  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.99 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4008  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.4 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3043  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.05 
 
 
372 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.640636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2945  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  51.6 
 
 
400 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0190627  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0074  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.82 
 
 
401 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4200  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.41 
 
 
376 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0697  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  47.7 
 
 
432 aa  351  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4950  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  50.81 
 
 
383 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0205  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  49.33 
 
 
377 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>