More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2212 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  78 
 
 
300 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.47 
 
 
298 aa  471  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.78 
 
 
296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0439  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.3 
 
 
302 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.45 
 
 
319 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.67 
 
 
287 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  37.21 
 
 
319 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0576  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.79 
 
 
287 aa  185  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.248124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.84 
 
 
302 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.87 
 
 
315 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.61 
 
 
313 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.69 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.8 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  36.61 
 
 
313 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  35.69 
 
 
312 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.61 
 
 
313 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.69 
 
 
312 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.61 
 
 
313 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  36.61 
 
 
313 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  35.69 
 
 
312 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.61 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.27 
 
 
313 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.35 
 
 
312 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.84 
 
 
311 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.03 
 
 
311 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  36.36 
 
 
312 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.84 
 
 
311 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.27 
 
 
313 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.84 
 
 
311 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.49 
 
 
311 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.81 
 
 
311 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.35 
 
 
312 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.57 
 
 
315 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  34.55 
 
 
313 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  35.69 
 
 
313 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  35.69 
 
 
313 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.02 
 
 
312 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  34.8 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  35.35 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.86 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.65 
 
 
314 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.27 
 
 
346 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.1 
 
 
313 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.43 
 
 
313 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.59 
 
 
610 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  36.59 
 
 
317 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.27 
 
 
346 aa  159  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.58 
 
 
601 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.02 
 
 
316 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.66 
 
 
326 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.71 
 
 
321 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.47 
 
 
321 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.62 
 
 
325 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.44 
 
 
296 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.28 
 
 
589 aa  155  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.75 
 
 
327 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.06 
 
 
325 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41 
 
 
334 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.89 
 
 
297 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
317 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.15 
 
 
322 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.4 
 
 
410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  37.3 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  37.3 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.44 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.33 
 
 
439 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.69 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.7 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1241  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.79 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0280664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.6 
 
 
320 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.44 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.6 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.12 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.09 
 
 
448 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34 
 
 
305 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.77 
 
 
315 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0463  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.3 
 
 
332 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.96 
 
 
295 aa  143  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.5 
 
 
443 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.31 
 
 
293 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  36.07 
 
 
341 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0970  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.17 
 
 
316 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.5 
 
 
443 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.69 
 
 
312 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.55 
 
 
340 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  36.43 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.4 
 
 
442 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.67 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.63 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.57 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1526  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.78 
 
 
295 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.13 
 
 
323 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.63 
 
 
338 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.56 
 
 
316 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.89 
 
 
328 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.57 
 
 
325 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.57 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.57 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>