93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4142 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  90.37 
 
 
218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  67.28 
 
 
218 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  57.21 
 
 
219 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  59.07 
 
 
216 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  58.6 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  64.81 
 
 
226 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  57.67 
 
 
216 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  54.5 
 
 
227 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  53.77 
 
 
231 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  49.77 
 
 
258 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  50.23 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  49.77 
 
 
214 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  44.76 
 
 
241 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  48.58 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  48.58 
 
 
224 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  48.48 
 
 
219 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  48.99 
 
 
220 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  43.54 
 
 
238 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  45.81 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
222 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  42.86 
 
 
214 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  40.31 
 
 
213 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  31.78 
 
 
211 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  32.09 
 
 
213 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  31.92 
 
 
210 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  33.5 
 
 
215 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  32.55 
 
 
214 aa  121  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  33.17 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
235 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.95 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  35.53 
 
 
237 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  34.39 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.47 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  29.27 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  31.88 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  30.7 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  29.17 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  31.53 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  34.33 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  31.07 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  32.2 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  33.33 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  29.65 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  34.81 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  33.83 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  34.21 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.88 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  29.05 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  32.8 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  27.23 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  29.05 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  28.37 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  33.51 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  33.51 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  32.46 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  31.16 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  30.33 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  31.82 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  28.86 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  33.33 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  24.63 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  24.87 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
241 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2571  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  30.61 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0546  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0574725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  22.34 
 
 
251 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0415  phosphoesterase  25.13 
 
 
234 aa  52  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2796  metallophosphoesterase  29.23 
 
 
228 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3084  metallophosphoesterase  41.94 
 
 
319 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  25.65 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0512  putative phosphoesterase  30.41 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.723947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
235 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5194  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0595  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.417936  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  24.34 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  27.87 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0534  phosphoesterase, putative  23.44 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.988231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2420  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>