32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3615 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 533 aa  1111    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  50.6 
 
 		 606 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 600 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 600 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.5 
 
 		 617 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  26.27 
 
 		 688 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  37.84 
 
 		 236 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  26.18 
 
 		 616 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.79 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.48 
 
 		 650 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.94 
 
 		 650 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 392 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.36 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  22.43 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  22.43 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  19.23 
 
 		 707 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 694 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  21.13 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  21.13 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  23.03 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  23.31 
 
 		 717 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  21.7 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  24.22 
 
 		 619 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  24.22 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  41.67 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  23.57 
 
 		 714 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2022  phage integrase  22.22 
 
 		 650 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>