58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0856 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  57.99 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  50.46 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  35.6 
 
 		 349 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  34.1 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  34.1 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  28.65 
 
 		 570 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  28.18 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  27.15 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  28.27 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  25.23 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  28.18 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  27.1 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  27.41 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  27.41 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  28 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  28.86 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  27.84 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  29.14 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  26.4 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  26.44 
 
 		 224 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  25.27 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  22.75 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  27.38 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  22.54 
 
 		 513 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  25.97 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  24.58 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  26.19 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  30.59 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  26.51 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  23.16 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  26.79 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  24.06 
 
 		 356 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  27.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  24.06 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  21.83 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  25.6 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  25.82 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  25.6 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  38.18 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  38.18 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  28.16 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  27.39 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  26.75 
 
 		 267 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  24.63 
 
 		 359 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>