127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0589 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  97.22 
 
 
324 aa  636  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
324 aa  649  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05960  serine/threonine protein kinase  85.49 
 
 
324 aa  572  1e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  83.64 
 
 
324 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  81.17 
 
 
324 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  80.86 
 
 
324 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  78.7 
 
 
324 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  6.88242e-12  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  80.25 
 
 
335 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  78.7 
 
 
324 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.40722e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0484  hypothetical protein  75 
 
 
324 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  76.54 
 
 
324 aa  506  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  61.61 
 
 
328 aa  399  1e-110  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  57.94 
 
 
355 aa  397  1e-110  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  60.37 
 
 
327 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2918  serine/threonine protein kinase  60.8 
 
 
328 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0203  serine/threonine protein kinase  59.08 
 
 
328 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.241241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0186  serine/threonine protein kinase  59.26 
 
 
328 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17305e-15 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3019  serine/threonine protein kinase  58.77 
 
 
328 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  58.33 
 
 
328 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.5453e-10  hitchhiker  4.6436e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1287  serine/threonine protein kinase  55.45 
 
 
330 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.10497e-10  hitchhiker  0.00149361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  56.04 
 
 
332 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2760  serine/threonine protein kinase  54.86 
 
 
339 aa  350  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  53.75 
 
 
327 aa  345  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  54.57 
 
 
342 aa  345  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  54.4 
 
 
329 aa  344  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  51.88 
 
 
333 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0540  serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
347 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205234  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  54.49 
 
 
343 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  53.12 
 
 
345 aa  340  3e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0421  serine/threonine protein kinase  53.45 
 
 
344 aa  339  3e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.083044  hitchhiker  0.000109607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 
342 aa  340  3e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0435  serine/threonine protein kinase  52.8 
 
 
350 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  52.35 
 
 
330 aa  337  1e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  54.55 
 
 
343 aa  337  1e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  54.55 
 
 
343 aa  337  1e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 
343 aa  337  2e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
346 aa  336  3e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
346 aa  336  3e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
343 aa  336  4e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3574  serine/threonine protein kinase  52.34 
 
 
321 aa  335  6e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  52.63 
 
 
359 aa  335  6e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  52.63 
 
 
340 aa  335  6e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  53.73 
 
 
343 aa  335  8e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  53.73 
 
 
343 aa  335  8e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  51.88 
 
 
351 aa  335  8e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  51.56 
 
 
345 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  53.25 
 
 
343 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  53.42 
 
 
343 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0936  serine/threonine protein kinase  53.27 
 
 
329 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0457  serine/threonine protein kinase  52.84 
 
 
348 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  50.75 
 
 
349 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
346 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0576  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
351 aa  328  7e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  48.9 
 
 
333 aa  327  1e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 
340 aa  327  2e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
334 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 
340 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  50.16 
 
 
340 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  49.84 
 
 
340 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  52.69 
 
 
346 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  54.21 
 
 
328 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  52.4 
 
 
346 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  48.84 
 
 
357 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0518  serine/threonine protein kinase  52.25 
 
 
346 aa  319  4e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271546  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  52.01 
 
 
341 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0310  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
342 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  49.84 
 
 
329 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.90223e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  50.15 
 
 
340 aa  314  1e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4349  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
328 aa  313  3e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4969  serine/threonine protein kinase  51.81 
 
 
344 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 
334 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1193  serine/threonine protein kinase  51.04 
 
 
354 aa  308  6e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  47.65 
 
 
340 aa  306  2e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  49.7 
 
 
354 aa  307  2e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  49.54 
 
 
338 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  47.65 
 
 
334 aa  302  5e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
327 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
328 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
328 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 
360 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
328 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.57443e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  45.62 
 
 
328 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.6631e-05  hitchhiker  8.28535e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  46.71 
 
 
328 aa  285  6e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 
328 aa  282  5e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  53.67 
 
 
303 aa  281  8e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 
328 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  46.71 
 
 
328 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
331 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 
328 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  43.26 
 
 
328 aa  270  3e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  43.26 
 
 
328 aa  270  3e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  43.26 
 
 
328 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  7.91829e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  43.26 
 
 
328 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  43.26 
 
 
328 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  43.26 
 
 
328 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.11117e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>