22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1962 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1962  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 642 aa  1326    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2022  phage integrase  24.91 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.49 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  25.37 
 
 		 324 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  32.24 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  32.24 
 
 		 617 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25.88 
 
 		 275 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  25 
 
 		 305 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  21.65 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  37.1 
 
 		 102 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 311 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  45 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  39.68 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  39.68 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 383 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.99 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  22.54 
 
 		 296 aa  43.9  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>