More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0590 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  89.68 
 
 
436 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
436 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  81.65 
 
 
436 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  91.06 
 
 
436 aa  785    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.24 
 
 
438 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.01 
 
 
438 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.47 
 
 
438 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 
434 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.64 
 
 
441 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.97 
 
 
435 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
433 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.11 
 
 
438 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.93 
 
 
435 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.38 
 
 
434 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.38 
 
 
434 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
431 aa  468  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.79 
 
 
431 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
431 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
447 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.42 
 
 
445 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.12 
 
 
431 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
432 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.58 
 
 
449 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
443 aa  390  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
427 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.95 
 
 
443 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.07 
 
 
419 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  43.99 
 
 
443 aa  350  4e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1184  predicted protein  44.21 
 
 
420 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.730647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.93 
 
 
418 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.64 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55086  delta l-pyrroline-5-carboxylate synthetase  43.11 
 
 
747 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.88 
 
 
416 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.5 
 
 
415 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.62 
 
 
421 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.85 
 
 
411 aa  330  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.35 
 
 
421 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.02 
 
 
415 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.28 
 
 
413 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  42.12 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.29 
 
 
418 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.41 
 
 
418 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.68 
 
 
416 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.35 
 
 
421 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.28 
 
 
420 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.41 
 
 
407 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.79 
 
 
418 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.19 
 
 
418 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.56 
 
 
418 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.5 
 
 
425 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.49 
 
 
418 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.2 
 
 
418 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.13 
 
 
417 aa  319  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.35 
 
 
413 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.94 
 
 
429 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.82 
 
 
421 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.97 
 
 
417 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.1 
 
 
423 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.58 
 
 
418 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.29 
 
 
424 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.31 
 
 
415 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.9 
 
 
421 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.19 
 
 
419 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
423 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.22 
 
 
419 aa  316  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.31 
 
 
407 aa  315  7e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.47 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.15 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.54 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.82 
 
 
418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.9 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18027  predicted protein  42.04 
 
 
706 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.1 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.48 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.66 
 
 
418 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.49 
 
 
418 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.8 
 
 
416 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.34 
 
 
425 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.39 
 
 
416 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.75 
 
 
416 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.12 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.39 
 
 
416 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.9 
 
 
421 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  40.87 
 
 
460 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.66 
 
 
418 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.75 
 
 
416 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.85 
 
 
415 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.15 
 
 
423 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.15 
 
 
423 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.26 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.89 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.19 
 
 
423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.63 
 
 
423 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.19 
 
 
432 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.91 
 
 
423 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.65 
 
 
435 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>