94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0025 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00241  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  92.84 
 
 		 363 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0025  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 		 363 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00241  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  93.66 
 
 		 363 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00241  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  83.2 
 
 		 363 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00251  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.99 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.665391  normal  0.112012 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00241  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.55 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1352  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.83 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0032  putative cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.06 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0028  putative cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00291  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.19 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2566  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.55 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1278  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.55 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2316  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.93 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0811  peptidylprolyl isomerase  39.72 
 
 		 368 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5085  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  41.48 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0453  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.47 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0466  Peptidylprolyl isomerase  42.47 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0741175  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1312  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  39.26 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38395  predicted protein  36.9 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11022  predicted protein  33.99 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0581  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  35.57 
 
 		 244 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1240  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  37.38 
 
 		 262 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.809669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1056  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  36.41 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0857508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0541  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  34.98 
 
 		 235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0558  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  34.48 
 
 		 235 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0511  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  34.29 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1245  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  31.31 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  36.84 
 
 		 517 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0653  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.34 
 
 		 243 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  32.51 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0670  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  31.5 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.454239  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12311  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.46 
 
 		 234 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0819658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1990  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  30.81 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.445693  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08461  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.21 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0530  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  28.79 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.708181 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0765  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.63 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16051  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.9 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06040  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  25.28 
 
 		 177 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000197808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09180  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  26.82 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.176223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  30.72 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  30.46 
 
 		 162 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.34 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  28.31 
 
 		 155 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1250  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  25.77 
 
 		 177 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0773  peptidylprolyl isomerase  26.47 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  25.88 
 
 		 571 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2309  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  28.57 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00964121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  26.98 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13321  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.81 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.497445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  24.57 
 
 		 161 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2070  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.83 
 
 		 163 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3820  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  28.81 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal  0.227787 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1305  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  27.12 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  25.86 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1530  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  25.37 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00140377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0558  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  27.12 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.608386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1186  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  26.55 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  24.86 
 
 		 156 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.12 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0814057  normal  0.454375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.42 
 
 		 179 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  27.78 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13471  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.13 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.543132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3616  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.34 
 
 		 155 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1254  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.49 
 
 		 201 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.580117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2056  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  24.87 
 
 		 279 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  25.71 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0068  peptidylprolyl isomerase  26.9 
 
 		 203 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15160  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  29.86 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121844 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13221  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.42 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1349  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  25 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  25.6 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.29 
 
 		 164 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  25.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2872  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.99 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  24.71 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  24.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  26.67 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6104  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family-like protein  24.6 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0460  peptidylprolyl isomerase  26.04 
 
 		 157 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.670535  hitchhiker  0.00463405 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.31 
 
 		 195 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  23.35 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0652  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  27.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  23.46 
 
 		 141 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  24.39 
 
 		 657 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02320  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 491 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-binding  24.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00742073  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0632  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.68 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3231  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  24.26 
 
 		 171 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1019  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.71 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1658  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  26.19 
 
 		 164 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  25.27 
 
 		 141 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  25.29 
 
 		 160 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1524  hypothetical protein  27.81 
 
 		 152 aa  42.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1816  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  23.53 
 
 		 276 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>