23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0009 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  100 
 
 		 89 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  97.75 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  61.8 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  61.8 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  60.67 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  56.18 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  57.3 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  60.67 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  56.18 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  56.18 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  55.06 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  53.93 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  53.93 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  49.44 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  48.31 
 
 		 89 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06080  hypothetical protein  30.85 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  25.88 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  27.71 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  26.51 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  26.51 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  30.77 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  29.89 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  28.99 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>