24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_14247 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00040  DNA polymerase gamma (AFU_orthologue; AFUA_5G12640)  47.19 
 
 		 1134 aa  952    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0503014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_14247  mitochondrial DNA polymerase catalytic subunit  100 
 
 		 1061 aa  2204    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00310  gamma DNA-directed DNA polymerase, putative  48.73 
 
 		 1376 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00002081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  25.5 
 
 		 893 aa  57  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  27.09 
 
 		 939 aa  54.3  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  26.45 
 
 		 888 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  25.94 
 
 		 957 aa  52  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  25.86 
 
 		 956 aa  51.6  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  25.61 
 
 		 921 aa  51.6  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  25.71 
 
 		 907 aa  50.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  23.97 
 
 		 903 aa  48.9  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  26.79 
 
 		 908 aa  48.5  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  24.8 
 
 		 926 aa  48.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  23.43 
 
 		 1013 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  24.19 
 
 		 968 aa  47  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  25.21 
 
 		 906 aa  47  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  25.31 
 
 		 943 aa  47  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  25.18 
 
 		 872 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  25.62 
 
 		 940 aa  45.8  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  24.79 
 
 		 931 aa  45.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  24.38 
 
 		 1004 aa  45.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  22.54 
 
 		 1043 aa  45.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 936 aa  44.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>