29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19835 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  31.31 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  31.55 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  36.15 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  35.58 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.83 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.07 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.73 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.1 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.1 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.13 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.16 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.06 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.1 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.54 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.2 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.68 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.93 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.56 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.13 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.07 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.29 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.04 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.4 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  32.04 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.91 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.13 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  25.75 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>