19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19615 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  100 
 
 		 121 aa  236  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  53.33 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  49.17 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85685  predicted protein  49.17 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  50.83 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  38.81 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  36.51 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  36.51 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  34.92 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  40.62 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  36.99 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  31.75 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  38.03 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  35.14 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  35.38 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>