More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19329 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  61.67 
 
 		 535 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  60.73 
 
 		 535 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  59.3 
 
 		 538 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  60.5 
 
 		 535 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  59.27 
 
 		 535 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  60.55 
 
 		 535 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  58.66 
 
 		 535 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  59.08 
 
 		 535 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  59.96 
 
 		 535 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 		 535 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  60.44 
 
 		 540 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  60.5 
 
 		 535 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 535 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  60.73 
 
 		 535 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  57.91 
 
 		 535 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  57.73 
 
 		 535 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  58.1 
 
 		 535 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  60.07 
 
 		 535 aa  673    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  59.39 
 
 		 536 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  58.78 
 
 		 535 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  60.89 
 
 		 541 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  60.73 
 
 		 546 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  60.55 
 
 		 535 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 535 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  60.12 
 
 		 516 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  61.82 
 
 		 534 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  60.73 
 
 		 535 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  62.4 
 
 		 535 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  59.82 
 
 		 535 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  58.1 
 
 		 535 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  59.92 
 
 		 535 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  61.45 
 
 		 534 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  60.5 
 
 		 535 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  59.82 
 
 		 535 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  60.55 
 
 		 535 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  60.73 
 
 		 535 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  61.48 
 
 		 535 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0975  propionyl-CoA carboxylase  61.43 
 
 		 535 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  59.96 
 
 		 535 aa  663    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  61.28 
 
 		 535 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4244  propionyl-CoA carboxylase  59.93 
 
 		 535 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1527  propionyl-CoA carboxylase  58.77 
 
 		 557 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  61.46 
 
 		 534 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  60.5 
 
 		 540 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 		 535 aa  670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  58.77 
 
 		 535 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  60.15 
 
 		 535 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  59.23 
 
 		 529 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  60 
 
 		 540 aa  668    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  60.31 
 
 		 534 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  60.89 
 
 		 535 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  60.73 
 
 		 535 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  62.25 
 
 		 535 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  60.74 
 
 		 535 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  59.48 
 
 		 553 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  58.47 
 
 		 553 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  59.82 
 
 		 535 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 552 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  61.63 
 
 		 535 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  59.62 
 
 		 536 aa  663    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  61.66 
 
 		 534 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  59.06 
 
 		 547 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  58.67 
 
 		 536 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  60.71 
 
 		 535 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  60.73 
 
 		 535 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  59.96 
 
 		 535 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 535 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  60.89 
 
 		 535 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  61.61 
 
 		 534 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  59.96 
 
 		 535 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  61.76 
 
 		 536 aa  668    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 		 535 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  59.27 
 
 		 535 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  60.55 
 
 		 535 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  59.15 
 
 		 554 aa  652    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  61.64 
 
 		 535 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  62.43 
 
 		 534 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  59.24 
 
 		 535 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  62.2 
 
 		 535 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19329  predicted protein  100 
 
 		 597 aa  1234    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  62.65 
 
 		 535 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  59.96 
 
 		 535 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 535 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  59.22 
 
 		 535 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  59.4 
 
 		 535 aa  665    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  61.73 
 
 		 536 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  60 
 
 		 535 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  59.59 
 
 		 535 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  60.71 
 
 		 535 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  60.08 
 
 		 547 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 		 535 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  59.54 
 
 		 535 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  59.96 
 
 		 535 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  57.95 
 
 		 535 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  59.59 
 
 		 535 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  61.08 
 
 		 534 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  59.78 
 
 		 535 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 		 535 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  59.59 
 
 		 535 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  60.18 
 
 		 535 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>