233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1953 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1953  YitT family protein  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  37.5 
 
 
301 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  32.31 
 
 
285 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  32.2 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  30.33 
 
 
283 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  31.27 
 
 
283 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.47 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  28.33 
 
 
290 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  27.67 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  29.1 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  28.1 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  28.2 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  28.1 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  26.69 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  29.01 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  27.45 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  26.8 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  25 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  30.54 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  27 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  29.53 
 
 
277 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  29.53 
 
 
277 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  25.17 
 
 
283 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  29.97 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0780  hypothetical protein  25.5 
 
 
293 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  28.81 
 
 
280 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  26.51 
 
 
295 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  27.97 
 
 
293 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  26.32 
 
 
290 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  29.83 
 
 
287 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  28.04 
 
 
286 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  25.52 
 
 
288 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  28.14 
 
 
290 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  27.92 
 
 
286 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  28.01 
 
 
301 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  27.39 
 
 
288 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  27.76 
 
 
287 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  27.15 
 
 
278 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  28.43 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  27.92 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  29.93 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  24.58 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  26.87 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  24.92 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  24.83 
 
 
306 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  24.92 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  24.58 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  25.99 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  27.21 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  24.58 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  24.58 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  24.58 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  24.58 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  27.34 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  24.58 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  25.67 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  24.24 
 
 
278 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  27.42 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  23.91 
 
 
278 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1475  protein of unknown function DUF161  25 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.01 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.26 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  25.17 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  25.17 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  24.83 
 
 
299 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  27.68 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  24.5 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  25.87 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  26.35 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  23.49 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  23.49 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2224  hypothetical protein  28.47 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00399664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1994  hypothetical protein  27.81 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000553659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  25.52 
 
 
297 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1070  hypothetical protein  29.97 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  24.83 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  23.43 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  23.43 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  23.43 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  23.43 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  23.43 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  24.34 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  24.72 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  22.73 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0536  protein of unknown function DUF161  26.79 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  26.53 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  24.24 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  22.33 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  25.5 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  23.88 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  26.2 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  22 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>